Zwischen den Tagungen der Kreissynode führt der Kreiskirchenrat die Geschäfte des Kirchenkreises. Der Kreiskirchenrat besteht im Kirchenkreis Friesland-Wilhelmshaven aus sieben stimmberechtigten Mitgliedern. Ihm gehören an:

Pfarrer Thorsten Harland, Kirchengemeinde Jever

Frau Dorthe Hoffmann, Kirchengemeinde Varel

Frau Ingrid Klebingat, Kirchengemeinde Bant

Frau Michaela Müller-Kleefeld, Kirchengemeinde Neuengroden

Pfarrer Kai Wessels, Kirchengemeinde Fedderwardergroden

Frau Jutta Wilhelms, Kirchengemeinde Schortens

Kreispfarrer Christian Scheuer als Vorsitzender

Stellvertretende Mitglieder sind: 

Herr Sönke Carstens, Kirchengemeinde Bockhorn

Herr Lothar Mehl, Kirchengemeinde Sande

Herr Lübbo Meppen, Kirchengemeinde Waddewarden-Westrum

Herr Manfred Pfaus, Kirchengemeinde Accum

Pfarrerin Meike von Fintel, Kirchengemeinde Heppens

Der Kreiskirchenrat tagt in der Regel monatlich.